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%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% LyX specific LaTeX commands.
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%% Because html converters don't know tabularnewline
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\begin{document}
\includegraphics[width=5cm]{img/Logo-INRAE_Transparent.png}

~

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\begin{center}

Tutoriel Pas-à-pas AdisTS - Pamhyr2

Version : Janvier 2025

\par\end{center}

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\begin{center}

\textbf{\LARGE Modélisation 1D du transport sédimentaire :  } \\
\textbf{\LARGE Cas du Vieux-Rhône de Miribel-Jonage}\\
\textbf{\LARGE (Lyon, France)}

\par\end{center}{\LARGE \par}

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\begin{center}
	\includegraphics[width=17cm]{img/Garde.jpeg}
	\par\end{center}
~

\begin{center}
{\large INRAE Lyon-Grenoble Auvergne-Rhône-Alpes}
\par\end{center}{\large \par}

\begin{center}

RiverLy, Hydraulique des rivières

\par\end{center}

~

\begin{center}
\begin{tabular}{lll}
Auteurs : & Dorian Hernandez & dorian.hernandez@inrae.fr\tabularnewline
	      & Théophile Terraz & theophile.terraz@inrae.fr\tabularnewline


\end{tabular}
\par\end{center}

~

\pagebreak{}

\begin{center}
\tableofcontents{}
\par\end{center}

~

\pagebreak{}

% \section{Introduction}
%
% TODO
%
% \pagebreak{}


\section{Ouvrir l'étude}

Lancez Pamhyr2.

Cliquez sur le bouton \includegraphics[width=0.5cm]{../../../src/View/ui/ressources/open.png} puis ouvrez le modèle Pamhyr2 \textit{Vieux\_Rhone\_TP\_AdisTS.pamhyr}.

Le modèle à un bief du Vieux-Rhône s'affiche sur la fenêtre graphique. 

\begin{center}
\includegraphics[width=15cm]{img/Open_model.jpeg}
\par\end{center}


\section{Mise en donnée}

\subsection{Création des classes de sédiments}

Dans la fenêtre principale, cliquez sur \texttt{[AdisTS] => [Polluants]} pour créer des classes de sédiments.

\begin{center}
\includegraphics[width=15cm]{img/Model_menu_Adists.jpeg}
\par\end{center}

La fenêtre \textit{Polluants - Vieux-Rhône} s'affiche. Elle va nous permettre de définir l'ensemble des caractéristiques (type de sédiment, taille moyenne, masse volumique,..) de nos classes de sédiments, ainsi que les conditions sédimentaires initiales et aux limites du modèle.

A l'aide du bouton \includegraphics[width=0.5cm]{../../../src/View/ui/ressources/add.png} inclure deux nouvelles classes de sédiments et les nommer \textit{Fines} et \textit{Sables}.

\begin{center}
	\includegraphics[width=15cm]{img/Polluants_fenetre.jpeg}
\par\end{center}

Pensez à sauvegarder régulièrement l'étude, à l'aide du bouton \includegraphics[width=0.5cm]{../../../src/View/ui/ressources/save.png} de la fenêtre principale.

\subsection{Caractéristiques et conditions initiales des sédiments}

Pour pouvoir attribuer des caractéristiques et des conditions initiales à une classe de sédiments, il faut d'abord la sélectionner. 

Cliquez sur la classe de sédiments \textit{Fines}, puis ouvrez la fenêtre \texttt{[Caractéristiques]}.

\begin{center}
	\includegraphics[width=15cm]{img/Pol_to_Caracteristique.jpeg}
\par\end{center}

La fenêtre d'édition de la classe de sédiments \textit{Fines} s'ouvre. 

\begin{center}
	\includegraphics[width=15cm]{img/caracteristique_fines_a_completer.jpeg}
	\par\end{center}

Celle-ci contient les informations nécessaire à la résolution des termes sources (taux d'érosion et de dépôt) de l'équation de transport-dispersion. Notamment pour le calcul de la vitesse de chute selon \cite{camenen_simple_2007} et la contrainte critique de mise en mouvement via l'approximation de \cite{soulsby_dynamics_1997}.

Complétez les valeurs manquantes du tableau selon les données de l'énoncé. Puis, fermez la fenêtre des caractéristiques. 

Ouvrez à présent la fenêtre de \texttt{[Conditions initiales]} (toujours pour les \textit{Fines}). 

\begin{center}
	\includegraphics[width=15cm]{img/CI.jpeg}
\par\end{center}

Cette fenêtre contient deux espaces permettant de définir la concentration initiale de \textit{Fines} (dans "l'eau" du bief) et l'épaisseur de dépôt de fines au fond du bief. Dans le compartiment de gauche, on définit les valeurs par défaut, appliquées à l'ensemble du bief. Le compartiment de droite permet d'imposer des conditions initiales différentes en fonction des PKs du bief. 

Nous considérerons une concentration initiale nulle en sédiments fins, ainsi qu'une épaisseur nulle au fond.\\ 
\\
Fermez la fenêtre de conditions initiales.\\
\\
Sélectionnez la classe de sédiments \textit{Sables} et répétez les étapes précédentes en considérant cette fois-ci les caractéristiques propres aux sables selon l'énoncé.

\subsection{Conditions aux limites}

Pour les conditions aux limites il n'est pas nécessaire de mettre en surbrillance les classes de sédiments.\\
\\
Ouvrez la fenêtre de \texttt{[Conditions aux limites]} et ajouter deux conditions aux limites de type concentration au n½ud amont du bief. Il y aura alors une condition aux limites pour chaque classe de sédiments. 

\begin{center}
	\includegraphics[width=15cm]{img/CL.jpeg}
\par\end{center}

Éditez la condition aux limites \textit{Fines} en la mettant en surbrillance et en cliquant sur le bouton \includegraphics[width=0.5cm]{../../../src/View/ui/ressources/edit.png}.\\
Créez une condition aux limites de type concentration constante de 0.060 $kg/m³$ en insérant deux lignes \textit{Temps/Concentration} à l'aide du bouton \includegraphics[width=0.5cm]{../../../src/View/ui/ressources/add.png}.

\begin{center}
	\includegraphics[width=15cm]{img/CL_edit.jpeg}
\par\end{center}

Procédez de la même façon pour la classe de sédiments \textit{Sables}, mais avec une concentration de 0.030 $kg/m³$.\\
\\
Fermez les fenêtres d'éditions des conditions aux limites et des polluants.

\subsection{Caractéristiques du fond fixe}

Dans la fenêtre principale, cliquez sur \texttt{[AdisTS] => [D90]}. Cette fenêtre permet de définir le diamètre des particules fixes au fond du canal, nécessaire pour le calcul du coefficient de Strickler à la manière de \cite{meyer-peter_formulas_1948}. De même que pour les conditions initiales des polluants, la fenêtre d'édition est divisée en deux parties afin d'introduire un paramètres par défaut et de laisser la possibilité d'appliquer des valeurs de $d_{90}$ variables le long du bief.
	
\begin{center}
	\includegraphics[width=15cm]{img/D90.jpeg}
\par\end{center}

Définissez 2 coefficients différents. Une valeur de 5 cm sur la partie amont (zone principale de dépôt de grossier) et 2 cm sur la partie avale.

\subsection{Coefficient de diffusion}

Le coefficient de diffusion $D_f$ comprend une part de diffusion moléculaire prise par défaut à $D_{mol}=10^{-6}$, à laquelle s'ajoutent les diffusions turbulentes et la dispersion sous forme d'un seul terme $D_{mix}$ défini selon les formules de \cite{fischer_discussion_1975}, \cite{elder_dispersion_1959} ou \cite{iwasa_predicting_1991}. Il est aussi possible d'utiliser une forme générique de $D_{mix}$ (voir doc utilisateur) ou encore d'imposer une valeur constante. Dans le cas tu TP nous choisirons Iwasa et Aya avec $\alpha=2$.

\begin{center}
	\includegraphics[width=15cm]{img/Diff.jpeg}
	\par\end{center}

\section{Paramètres du solveur}

Dans la fenêtre principale, cliquez sur \texttt{[Exécuter] => [Paramètres numériques des solveurs]}.
Dans la fenêtre \textit{Paramètres du solveur}, sélectionnez l'onglet \texttt{[Adis-TS\_WC]}.

Ces paramètres pilotent le comportement du solveur numérique. On retrouve notamment les temps de début et de fin de la simulation. Le pas de temps maximal en secondes pour le calcul. Le paramètre d'implicitation du schéma numérique de Crank-Nicholson (0.5 comme valeur recommandée). Les temps d'écriture des fichiers .bin, .csv (pour l'export à la volée), et de l'affichage à l'écran. On retrouve aussi la possibilité d'appliquer une concentration initiale.


Exemple de valeurs des paramètres : 

\begin{center}
	\includegraphics[width=15cm]{img/Execute_param.jpeg}
	\par\end{center}

Fermez la fenêtre \textit{Paramètres du solveur}.

\section{Lancer une simulation}

Avant de lancer AdisTS, il est nécessaire d'avoir une première solution hydraulique.

Vérifiez que les conditions aux limites amont et aval sélectionnées sont bien celles correspondantes à l'hydrogramme et au limnigramme du scénrio souhaité.

\begin{center}
	\includegraphics[width=15cm]{img/CL_verif.jpeg}
	\par\end{center}

Dans la fenêtre principale, cliquez sur \texttt{[Exécuter] => [Lancer le solveur]}.
Sélectionnez \textit{Defaut-Mage - (Mage8)} et cliquez sur le bouton \textit{Lancer}.
La fenêtre \textit{Log du solveur} s'ouvre.
Cette fenêtre affiche les sorties texte du solveur.
À partir de la fenêtre \textit{Log du solveur}, il est possible de réexécuter le calcul en cliquant sur l'icône \includegraphics[width=0.5cm]{../../../src/View/ui/ressources/run.png}. Cliquez sur le bouton \textit{Résultats} pour ouvrir la fenêtre \textit{Résultats} de Mage.

Dans la fenêtre principale, cliquez sur \texttt{[Exécuter] => [Lancer AdisTS]}.
Sélectionnez \textit{Defaut-AdisTS - (adistswc)} et cliquez sur le bouton \textit{Lancer}.
La fenêtre \textit{Log du solveur} s'ouvre.
Cette fenêtre affiche les sorties texte du solveur. Si le calcul s'est déroulé correctement, la fenêtre log devrait ressembler à celle-ci : 

\begin{center}
	\includegraphics[width=15cm]{img/log.jpeg}
\par\end{center}


Cliquez sur le bouton \textit{Résultats} pour ouvrir la fenêtre \textit{Résultats} de AdisTS. Il est aussi possible de ré-ouvrir les résultats de Mage en cliquant sur le bouton \textit{Résultats Mage}.

\section{Visualisation et export de résultats}

Il est aussi possible d'ouvrir la fenêtre \textit{Résultats} si vous avez fermé la fenêtre \textit{Log du solveur}, en cliquant sur \texttt{[Résultats] => [Visualiser les derniers résultats]} à partir de la fenêtre principale. Les résultats affichés sont ceux de AdisTS.

\begin{center}
	\includegraphics[width=15cm]{img/Results.jpeg}
\par\end{center}

Le panneau supérieur gauche permet de sélectionner le bief, le panneau du milieu gauche permet de sélectionner une section dans ce bief et le panneau inférieur gauche permet de sélectionner la classe de sédiments dont on veut extraire des résultats. 
La fenêtre de droite possède 4 onglets. Chaque onglet présente des résultats en fonction du temps (un curseur en bas de la fenêtre permet de visualiser les résultats à différents pas de temps) : 

\begin{itemize}
	\item Le premier onglet correspond aux données brutes de concentration dans l'eau et de masse déposée pour chaque classe de sédiments de l'étude.
	\item Le deuxième onglet est divisée en deux sous-onglets permettant de visualiser de deux façons différentes la concentration de la classe de sédiments sélectionnée : soit en fonction du PK du bief, soit en fonction du temps.
	\item De même, le troisième onglet est divisé en deux sous-onglets permettant de visualiser cette fois-ci la masse linéique de sédiments s'étant déposés.
	\item Enfin le dernier onglet présente l'épaisseur des sédiments déposés.
\end{itemize}

Il est possible d'exporter les résultats au format CSV en cliquant sur le bouton \includegraphics[width=0.5cm]{../../../src/View/ui/ressources/export.png} en haut à gauche de la fenêtre.

\begin{center}
	\includegraphics[width=15cm]{img/Export_res_adis.jpeg}
\par\end{center}

Répétez les étapes 4 et 5, selon différents scénarios hydrauliques.

\section{Bonus}

Ajoutez une épaisseur initiale de 1 cm de sédiments \textit{Sables} au fond et relancer un calcul avec le scénario 1.



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\bibliography{Biblio.bib}


\pagebreak{}
\end{document}
